３.提供生物技術(shù)時附帶提供的微生物菌種母本和動、植物新品種，應(yīng)包括在免征營業(yè)稅的營業(yè)額內(nèi)。但批量銷售的微生物菌種，應(yīng)當(dāng)征收增值稅。
     （三）免稅的審批程序
     １.納稅人從事技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開發(fā)業(yè)務(wù)申請免征營業(yè)稅時，須持技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開發(fā)的書面合同，到納稅人所在地省級科技主管部門進(jìn)行認(rèn)定，再持有關(guān)的書面合同和科技主管部門審核意見證明報當(dāng)?shù)厥〖壷鞴芏悇?wù)機關(guān)審核。
     外國企業(yè)和外籍個人從境外向中國境內(nèi)轉(zhuǎn)讓技術(shù)需要免征營業(yè)稅的，需提供技術(shù)轉(zhuǎn)讓或技術(shù)開發(fā)書面合同、納稅人或其授權(quán)人書面申請以及技術(shù)受讓方所在地的省級科技主管部門審核意見證明，經(jīng)省級稅務(wù)主管機關(guān)審核后，層報國家稅務(wù)總局批準(zhǔn)。①
     ２.在科技和稅務(wù)部門審核批準(zhǔn)以前，納稅人應(yīng)當(dāng)先按有關(guān)規(guī)定繳納營業(yè)稅，待科技、稅務(wù)部門審核后，再從以后應(yīng)納的營業(yè)稅款中抵交，如以后一年內(nèi)未發(fā)生應(yīng)納營業(yè)稅的行為，或其應(yīng)納稅款不足以抵頂免稅額的，納稅人可向負(fù)責(zé)征收的稅務(wù)機關(guān)申請辦理退稅。②
     三、關(guān)于所得稅
     （一）對社會力量，包括企業(yè)單位（不含外商投資企業(yè)和外國企業(yè)）、事業(yè)單位、社會團(tuán)體、個人和個體工商戶（下同），資助非關(guān)聯(lián)的科研機構(gòu)和高等學(xué)校研究開發(fā)新產(chǎn)品、新技術(shù)、新工藝所發(fā)生的研究開發(fā)經(jīng)費，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核確定，其資助支出可以全額在當(dāng)年度應(yīng)納稅所得額中扣除。當(dāng)年度應(yīng)納稅所得額不足抵扣的，不得結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。
     非關(guān)聯(lián)的科研機構(gòu)和高等學(xué)校是指，不是資助企業(yè)所屬或投資的，并且其科研成果不是唯一提供給資助企業(yè)的科研機構(gòu)和高等學(xué)校。
     企業(yè)向所屬的科研機構(gòu)和高等學(xué)校提供的研究開發(fā)經(jīng)費資助支出，不實行抵扣應(yīng)納稅所得額辦法。
     企業(yè)等社會力量向科研機構(gòu)和高等學(xué)校資助研究開發(fā)經(jīng)費，申請抵扣應(yīng)納稅所得額時，須提供科研機構(gòu)和高等學(xué)校開具的研究開發(fā)項目計劃、資金收款證明及其他稅務(wù)機關(guān)要求提供的相關(guān)資料，不能提供相關(guān)資料的，稅務(wù)機關(guān)可不予受理。
     （二）軟件開發(fā)企業(yè)實際發(fā)放的工資總額，在計算應(yīng)納稅所得額時準(zhǔn)予扣除。
     四、關(guān)于外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅
     外商投資企業(yè)和外國企業(yè)資助非關(guān)聯(lián)科研機構(gòu)和高等學(xué)校研究開發(fā)經(jīng)費，參照《中華人民共和國外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅法》中有關(guān)捐贈的稅務(wù)處理辦法，可以在資助企業(yè)計算企業(yè)應(yīng)納稅所得稅額時全額扣除。
     五、關(guān)于進(jìn)出口稅收
     （一）對企業(yè)（包括外商投資企業(yè)、外國企業(yè)）為生產(chǎn)《國家高新技術(shù)產(chǎn)品目錄》的產(chǎn)品而進(jìn)口所需的自用設(shè)備及按照合同隨設(shè)備進(jìn)口的技術(shù)及配套件、備件。除按照國發(fā)［１９９７］３７號文件規(guī)定《國內(nèi)投資項目不予免稅的進(jìn)口商品目錄》所列商品外，免征關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅。
     （二）對企業(yè)（包括外商投資企業(yè)、外國企業(yè)）引進(jìn)屬于《國家高新技術(shù)產(chǎn)品目錄》所列的先進(jìn)技術(shù)，按合同規(guī)定向境外支付的軟件費，免征關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅。
     軟件費是指進(jìn)口貨物的納稅義務(wù)人為在境內(nèi)制造、使用、出版、發(fā)行或者播映該項貨物的技術(shù)和內(nèi)容，向境外賣方支付的專利費、商標(biāo)費以及專有技術(shù)、計算機軟件和資料等費用。
     （三）對列入科技部、外經(jīng)貿(mào)部《中國高新技術(shù)商品出口目錄》的產(chǎn)品，凡出口退稅率未達(dá)到征稅率的，經(jīng)國家稅務(wù)總局核準(zhǔn)，產(chǎn)品出口后，可按征稅率及現(xiàn)行出口退稅管理規(guī)定辦理退稅。
     六、科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制問題
     （一）中央直屬科研機構(gòu)以及省、地（市）所屬的科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制后，自1999年至2003年5年內(nèi)，免征企業(yè)所得稅和科研開發(fā)自用土地的城鎮(zhèn)土地使用稅。
     本條所指科研機構(gòu)不包括：已經(jīng)轉(zhuǎn)制和已并入企業(yè)的科研機構(gòu)，以及所有從事社會科學(xué)研究
    的科研機構(gòu)。
     （二）享受上述稅收優(yōu)惠政策的科研機構(gòu)，需持轉(zhuǎn)制變更后的企業(yè)工商登記材料報當(dāng)?shù)刂鞴芏悇?wù)機關(guān)，并按規(guī)定辦理有關(guān)減免稅手續(xù)。